1、原材料不同：发酵乳的原材料是鲜乳或者乳制品。酸奶的主要原材料是牛奶，然后再加入乳糖，葡萄糖等添加剂。
2、制作过程不同：酸奶是以保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌为主要菌种的发酵奶制品。这两种菌来源于牛乳自然发酵液中，它不是人体肠道中自有生物菌群，所以不能在人体肠道内存活和定植。酵乳是通过非保加利亚乳杆菌发酵的各种乳制品。主要有酸牛乳、活性乳、以及干酪、酸性奶油等。含有大量有益活性菌的发酵乳更是营养与保健兼备食品 。
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