莲子为小坚果。呈椭圆形、卵形或卵圆形,其大小因品种而异,一般长1、6至1、8厘米,宽1、1至1、2厘米,千粒重1100至1400克,幼果期果皮绿色,革质,后由绿转褐色,成熟时呈棕褐色、灰褐色和黑褐色。有细纵纹和较宽的脉纹。一端中心呈乳头状突起,深棕色,多有裂口,其周边略下陷。质硬。种皮薄,不易剥离。子叶黄白色,肥厚,中有空隙,具绿色莲子心,无臭,味甘、微涩。