机体对病毒的抵抗力是决定病毒感染过程的另一个重要因素。在未曾感染或未曾进行过人工免疫的机体，病毒感染过程取决与机体的非特异性抵抗力，包括宿主的年龄、激素、体温、中枢神经活动以及营养等因素。感染与病毒的表面糖基化的配体，以及宿主细胞的受体，以及传播的介质等有关，与立体结构和致病性没有必然的联系。吸附于宿主细胞的能力只需要数个特定的与细胞表面受体结合的蛋白的参与，而这几个蛋白通常与病毒的总体立体结构没有必然联系。
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