基础医学和临床医学的区别是：基础医学研究医学基础，比如解剖、生理、生化、微生物等等，临床医学就是我们去医院看见的那些门诊，内外科、五官科、眼科、皮肤科等等，其实两个专业都有临床的可能，但是临床专业的临床时间更长，因为他们还有一年起步的临床实习期。
基础医学和临床医学专业大方向不同：
基础医学更加偏理论，临床医学更偏实践，学习基础医学也有实践，但一般都是实验课，临床医学则是直接面对病人，需要面对各种突发情况，解决当下发生的事情。而基础医学的方向是深究某个理论，走在临床/实践医学的前面。
基础医学和临床医学就业方向不同：
基础医学毕业以后在研究所工作，或者是生物技术公司、医疗工作，从事研发之类的工作。
而临床医学一般都在前线，可以当医生、也可以从事麻醉学、放射科、等等岗位。在医院工作需要考执业医师整，而基础医学专业是不能考这个证的。
1、基础医学(英语缩写BMS)，属于基础学科，是现代医学的基础。基础医学是研究人的生命和疾病现象的本质及其规律的自然科学。其所研究的关于人体的健康与疾病的本质及其规律为其他所有应用医学所遵循。
基础医学专业培养具备自然科学、生命科学和医学科学基本理论知识和实验技能，基础医学毕业能够在高等医学院校和医学科研机构等部门从事基础医学各学科的教学、科学研究及基础与临床相结合的医学实验研究工作的医学高级专门人才。
2、临床医学是研究疾病的病因、诊断、治疗和预后，提高临床治疗水平，促进人体健康的科学。
临床即“亲临病床”之意，临床医学是研究疾病的病因、诊断、治疗和预后，提高临床治疗水平，促进人体健康的科学。它根据病人的临床表现，从整体出发结合研究疾病的病因、发病机理和病理过程，进而确定诊断，通过预防和治疗以最大程度上减弱疾病、减轻病人痛苦、恢复病人健康、保护劳动力。临床医学是直接面对疾病、病人，对病人直接实施治疗的科学。
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