生物医学工程就业前景是很好的，有很医疗公司的岗位都是针对生物医学工程专业的。骨科医院的放疗科和二、三甲医院的设备科，都是明确招聘专业为生物医学工程。所以，如果专业对口，国内学这个专业的比较是少数，能很好的进去医院工作。
生物医学工程专业的就业前景很好，毕业生的主要就业方向为管理机构和国家机关、医学机构、国际制药、保健品企业等地方工作。
生物医学工程专业可以说是个万金油专业，本科阶段的学习只是个基础，如果想要深造，或是暂时就业前景比较严峻，可以选择考研，各个学校的侧重点不同，考研的科目也许会有变化。
选医学图像信号处理方向或者生物信息学工作情况也比较乐观，但是需要较强的代码编写能力。结合近几年互联网的发展情况，纯生物的方向并不是一个明智的选择，当然仅限于国内。如果仅做研究工作，建议到国外发展。
由于生物医学工程学科是应用最先进的理工科的理论与方法来研究人的生命现象与规律，因此其研究领域极其广泛，其研究方向也非常多。在每一个方向上又有着非常宽广的内容。因此，生物医学工程领域也是今后几十年内最容易出现理论突破和技术创新的学科领域之一。
一般来说，生物医学工程就业方向还是很广的，绝大部分本科毕业生都会选择考研乃至考博来继续深造，过来人都知道，该专业对学历的要求还是挺高的，要想在本学科有所建树或想从事高级技术工作的人必须走读研这条路。而且，学历越高的人，不仅选择面大，还可以延伸到更多相关领域，比如生物、制药、食品等。
生物医学工程专业毕业之后适合到医药、食品、环保、商检等部门当中从事生物产品的技术开发、工程设计、生产管理及产品性能检测分析等工作，或是教学部门的研究与教学工作;还可以去国家医疗器械司或各级医疗器械检测所;也可以到各级医院的医学工程处、设备处、信息中心以及医学影像科工作;另外，各大跨国或是国内医疗器械企业也是生物医学工程专业相当不错的选择。
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