原产地不同：南瓜原产于墨西哥到中美洲一带，北瓜原产于南美洲的玻利维亚、智利和阿根廷等地。种子不同：南瓜的种子一般呈长卵形或长圆形，北瓜的种子丰满，扁平，边缘钝或拱起。
果梗不同：虽然南瓜和北瓜的果梗都粗壮，但是南瓜的果梗有棱和槽，而北瓜的果梗不具有棱和槽。
营养不同：南瓜含有丰富的纤维素、抗干扰素、维生素A等，南瓜含有丰富的多糖类物质、β-胡萝卜素、矿物质元素等。
北瓜和南瓜都是葫芦科南瓜属植物，一年生蔓生草本植物，在我南北方均有栽培。
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