鳄鱼有舌头，鳄鱼的舌头紧贴在下颚，不容易发现。当鳄鱼张开嘴时，舌头会有抬升。鳄鱼的舌头具有重要的作用。当鳄鱼在水中张嘴时，舌头会抵住喉咙，防止水进入肺部，导致溺水。另外，鳄鱼的舌头在排出身体内部盐分时，也发挥着重要的作用。
鳄鱼是高等的爬行动物，它用肺呼吸，心脏分为四个室，它的口腔顶壁上有一块骨质的腭，把鼻腔和口腔隔开，它的牙齿只生在上下颌的齿槽内，而这些都和哺乳动物相似，这说明哺乳动物是由爬行动物进化来的。鳄鱼的两只眼睛长在头部的上端，它除了眼睑以外，还有透明的瞬膜，这种结构使它能适应水中的环境。由于鳄鱼的鼻孔位于上端的背面，里面有瓣膜，所以在它潜入水中时，瓣膜自动关闭，可以防止水流入鼻孔内，在它的咽部，还有一个薄而富有弹性的膜，当这块膜一关闭，那么其口腔和呼吸道便隔开，因此，它在水中即使张大了嘴，水也不会进入呼吸道及肺部。它那长而粗的尾巴，既是游泳时的 “舵”、又是捕食的工具和御敌的武器。
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