培养目的不同：专业型硕士是培养具有扎实理论基础，并适应特定行业或职业实际工作需要的应用型高层次专门人才。在职研究生是国家计划内，以在职人员的身份，半脱产，部分时间在职工作，部分时间在校学习的研究生学历教育的一种类型。
学习方式不同：专业型硕士的主要学习方式有全日制、周末班和集中班。全日制需要攻读者全天上课；周末班通常是在周六日上课；集中班主要在寒暑假、国庆等长假时间里上课。在职研究生专门为工作人员开设，其学习方式一般有周末班、集中班和网络班三种。周末班通常是周六日上课，属于隔周上课制；集中班也是在一些长假时间里上课；网络班是视频教学制，攻读者可随时随地通过手机或电脑来观看视频学习课程。
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