分子科学与工程专业主要课程如下：
1、化学类课程：无机化学、有机化学、分析化学、物理化学、结构化学、仪器分析与技术、生物化学、高分子化学、高分子物理、高等无机化学、高等有机化学、无机材料化学；
2、化工类课程：化工原理、化工热力学、化学反应工程、绿色化学工艺学、化工设计、生物化工、化工分离工程、环境化工、化工安全与环保、功能材料物理性能、功能高分子材料、药物分析、材料物理性能、材料结构分析等。
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